ISSN: 0377-9777 / e-ISSN: 1308-2523
Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi
Yoğun bakım ünitelerinde yatan hastaların kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotik duyarlılıkları [Turk Hij Den Biyol Derg]
Turk Hij Den Biyol Derg. 2017; 74(4): 269-278 | DOI: 10.5505/TurkHijyen.2017.94899

Yoğun bakım ünitelerinde yatan hastaların kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotik duyarlılıkları

M. Cem Şirin, Neval Ağuş, Nisel Yılmaz, Arzu Bayram, Sevgi Yılmaz Hancı, Pınar Şamlıoğlu, Yeşer Karaca Derici, Güliz Doğan
İzmir Tepecik Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı, İzmir

GİRİŞ ve AMAÇ: Kan dolaşımı infeksiyonlarına yol açan etkenlerin ve antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi, klinisyeni doğru ve uygun ampirik tedaviye yönlendirmek açısından önemlidir. Bu çalışmada, hastanemiz yoğun bakım ünite (YBÜ)'lerinde yatan hastaların kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmaların dağılımının ve antibiyotik duyarlılıklarının incelenmesi amaçlanmıştır.
YÖNTEM ve GEREÇLER: Kan örnekleri BacT/ALERT 3D (bioMérieux, Fransa) otomatik kan kültürü sisteminde inkübe edilmiştir. İzole edilen bakteri suşlarının tanımlanması ve antibiyotik duyarlılık testleri Vitek 2 compact (bioMérieux, Fransa) otomatize sistemi ile yapılmıştır. Vankomisin, teikoplanin, linezolid, imipenem ve meropenem direnci E-test (bioMérieux, Fransa) yöntemiyle doğrulanmıştır. Maya mantarlarının tanımlanması ve antifungal duyarlılık testleri için API ID 32C ve API ATB Fungus 3 (bioMérieux, Fransa) kitleri kullanılmıştır.
BULGULAR: İzole edilen 829 mikroorganizmanın 372’si (%44.9) gram pozitif, 334'ü (%40.3) gram negatif bakteri, 123'ü (%14.8) maya mantarı olarak tanımlanmıştır. En sık izole edilen etkenler; sırasıyla koagülaz negatif stafilokoklar (KNS) (%25.3), Enterococcus spp. (%13.6), Acinetobacter spp. (%13.1), Candida parapsilosis (%8.3), Escherichia coli (%7.9), Klebsiella spp. (%7), Staphylococcus aureus (%4.9), Pseudomonas aeruginosa (%4.8), Candida albicans (%4.7), Serratia marcescens (%2.8), Proteus spp. (%1.8), ve Enterobacter spp. (%1.7) olarak belirlenmiştir. KNS suşlarının %79.5'u, S.aureus suşlarının %12.2'si metisiline dirençli olarak saptanmıştır. Stafilokok suşları ve Enterococcus faecalis'de glikopeptid ve linezolid direncine rastlanmazken, Enterococcus faecium suşlarında %15.5 vankomisin, %13.8 teikoplanin ve %1.7 linezolid direnci görülmüştür. Karbapenem direnci Acinetobacter baumannii'de %90.4, P.aeruginosa'da %45, S.marcescens'de %8.7 ve Klebsiella spp.'de %8.6 olarak bulunurken, kolistin direncine rastlanmamıştır. C.parapsilosis en sık izole edilen maya türü olarak saptanırken, Candida türlerine karşı en etkili antibiyotikler flusitozin ve amfoterisin B olarak bulunmuştur.
TARTIŞMA ve SONUÇ: Hastanemiz YBÜ'lerinde yatan hastaların kan kültürlerinden vankomisine dirençli enterokokların, çoklu antibiyotik direnci gösteren A.baumannii, P.aeruginosa ve K.pneumoniae suşlarının izole edilmesi; daha etkin infeksiyon kontrol programlarının ve akılcı antibiyotik kullanım politikalarının uygulanması gerektiğini göstermiştir.

Anahtar Kelimeler: kan kültürü, yoğun bakım ünitesi, antibiyotik direnci

Microorganisms isolated from blood cultures of the patients in intensive care units and their antibiotic susceptibilities

M. Cem Şirin, Neval Ağuş, Nisel Yılmaz, Arzu Bayram, Sevgi Yılmaz Hancı, Pınar Şamlıoğlu, Yeşer Karaca Derici, Güliz Doğan
Izmir Tepecik Training and Research Hospital, Department of Medical Microbiology, Izmir, Turkey

INTRODUCTION: The identification and determination of antibiotic susceptibilities of the agents causing bloodstream infections is of importance in respect of guiding the clinician to a correct and appropriate empirical therapy. The aim of this study was to investigate the distribution and antibiotic susceptibilities of microorganisms isolated from the blood cultures of patients in our hospital intensive care units (ICUs).
METHODS: The blood samples were incubated in the BacT/ALERT 3D (bioMérieux, France) automated blood culture system. Identification and antibiotic susceptibility testing of the isolated bacterial strains were performed by Vitek 2 compact (bioMérieux, France) automated system. Vancomycin, teicoplanin, linezolid, imipenem and meropenem resistance was confirmed by E-test (bioMérieux, France) method. API ID 32C ve API ATB Fungus 3 (bioMérieux, France) kits were used for the identification and antifungal susceptibility testing of the yeasts.
RESULTS: Of the isolated 829 microorganisms, 372 (44.9%) of them were identified as gram positive, 334 (40.3%) were gram negative bacteria and 123 (14.8%) were yeasts. The most frequently isolated agents were determined as coagulase-negative staphylococci (CNS) (%25.3), Enterococcus spp. (%13.6), Acinetobacter spp. (%13.1), Candida parapsilosis (%8.3), Escherichia coli (%7.9), Klebsiella spp. (%7), Staphylococcus aureus (%4.9), Pseudomonas aeruginosa (%4.8), Candida albicans (%4.7), Serratia marcescens (%2.8), Proteus spp. (%1.8), and Enterobacter spp. (%1.7), respectively. Methicillin resistance was found in 79.5% of CNS and 12.2% of S.aureus strains. No glycopeptide and linezolid resistance was found in staphylococci and Enterococcus faecalis strains, and vancomycin, teicoplanin and linezolid resistance in Enterococcus faecium strains was determined as 15.5%, 13.8% and 1.7%, respectively. Carbapenem resistance was found as 90.4% in Acinetobacter baumannii, 45% in P.aeruginosa, 8.7% in S.marcescens and 8.6% in Klebsiella spp. and there was no resistance to colistin. C.parapsilosis was the most commonly isolated yeast species. Flucytosine and amphotericin B were found to be the most effective antibiotics for Candida species.
DISCUSSION AND CONCLUSION: The isolation of vancomycin-resistant enterococci, multi-antibiotic resistant A.baumannii, P.aeruginosa and K.pneumoniae strains from the blood cultures of patients in our hospital ICUs has indicated that more effective infection control programs and rational antibiotic use policies should be implemented.

Keywords: blood culture, intensive care unit, antibiotic resistance

M. Cem Şirin, Neval Ağuş, Nisel Yılmaz, Arzu Bayram, Sevgi Yılmaz Hancı, Pınar Şamlıoğlu, Yeşer Karaca Derici, Güliz Doğan. Microorganisms isolated from blood cultures of the patients in intensive care units and their antibiotic susceptibilities. Turk Hij Den Biyol Derg. 2017; 74(4): 269-278

Sorumlu Yazar: M. Cem Şirin, Türkiye
Makale Dili: Türkçe
LookUs & Online Makale
w